По замечанию Ю. Майстера: «На основании плохих результатов использования русских подводных лодок в предыдущем году немцы очень низко расценивали их возможности в 1942 году. Однако переговоры между немецкими и финскими инстанциями, имевшие место 12 марта 1942 года, обозначили некоторое расхождение мнений по этому вопросу. Немцы полагали, что им удастся заблокировать Финский залив с помощью мин и охотников за подводными лодками, а финны считали эти меры недостаточными и стремились уговорить немцев поставить там сетевое заграждение. Но в 1942 году ни в Финляндии, ни в Германии не имелось подходящего для этого сетей».

    Основные острова Гогландского плеса были в руках противника. Это позволяло немцам и финнам перекрыть доступ советским подводным лодкам в Балтийское море. Готовясь к летней кампании 1942 года, противник установил на островах посты наблюдения, радиопеленгаторные и гидроакустические станции. 9 мая немцы начали постановку мин в Финском заливе. Подновлялись и усиливались старые заграждения, устанавливались новые. Наиболее обширными и многочисленными из них были «Насхорн» (между Порккала-Удд и островом Найсаар, всего 1.915 мин) и «Зееигель» (восточнее Гогланда, всего 5.779 мин, 1.450 минных защитников, 200 подрывных шашек). Всего весной – летом 1942 года немцами в Финском заливе выставлено 12.873 мины. Вместе с минами, которые были выставлены в прошлом году, их количество в Финском заливе превышало 21 тысячу. Непосредственно у заграждений было развернуто более сотни различных кораблей и катеров. Таким образом, образовался противолодочный рубеж глубиной более 150 миль.

    В руководстве бригады подводных лодок КБФ к этому времени произошли изменения. 4 марта командование над ней принял контр-адмирал А.М.Стеценко. 1-й дивизион (командир капитан 2 ранга Юнаков Е.Г.) включал в себя подводные лодки «С-4», «С-7», «С-9», «С-12», «С-13» и «Д-2» при плавбазе «Смольный», 2-й дивизион (командир капитан 2 ранга Полещук В.А.) состоял из подводных минных заградителей «Л-3» и «Лембит» при плавбазе «Иртыш», 3-й дивизион (командир капитан 2 ранга Червинский В.А., с 3 апреля врид капитан 3 ранга Кабо И.С., с мая командир капитан 2 ранга Гольдберг Г.А.) в котором при плавбазе «Полярная Звезда» состояли «Щ-303», «Щ-304», «Щ-309», «Щ-310», «Щ-311», «Щ-405», «Щ-406», 4-й дивизион (командир капитан 2 ранга Егоров В.А., с июля врид капитан 2 ранга Андронов А.Г.) включал в себя «Щ-317», «Щ-318», «Щ-320», «Щ-323», «Щ-407», «Щ-408» при плавбазе «Ока», в 5-й дивизион (командир капитан 2 ранга Сидоренко П.А.) при плавбазе «Аэгна» входили «М-90», «М-95», «М-96», «М-97», «М-102», «М-77», «М-79». Отдельный учебный дивизион (командир капитан 2 ранга Эйхбаум Н.Э.) при плавбазе «Дус» включал в себя «П-2», «П-3», «Щ-302», «Щ-305», «Щ-306», «Щ-307», «Щ-308». В дивизион вновь строящихся и капитально ремонтирующихся кораблей (командир капитан 2 ранга Шевцов Е.В.) входили «К-51», «К-52», «К-53», «К-54», «К-55», «К-56», «Л-21», «Щ-411», «Щ-412», «Щ-413», «Щ-414» и законсервированные «М-72», «М-73», «М-74», «М-75», «М-76», «Р-1», «М-400».

    Подводные лодки КБФ, несмотря на неудачи прошлого года, готовились дать бой врагу. Согласно планам командования с июня по октябрь месяц предполагался выход в трех эшелонах по 8-10 подводных лодок. Их развертывание намечалось проводить в три этапа. На первом этапе подводные лодки проходили размагничивание и переходили из Ленинграда в Кронштадт. Из-за малых глубин подводные лодки были вынуждены идти в надводном положении, возможности для маневра не было, поэтому главной опасностью, ждущей их здесь, являлись артиллерия противника из района Петергоф – Стрельна и магнитные мины. Переход осуществлялся в темное время суток, а в период белых ночей широко применялись дымовые завесы. По прибытии в Кронштадт подводные лодки снова проходили размагничивание и загружались необходимым топливом, боеприпасами, продовольствием. Вторым этапом был переход из Кронштадта на Лавенсари, который так же проходил в зоне, контролируемой кораблями КБФ. До Шепелевского маяка подводные лодки должны были идти под эскортом катеров, а далее в надводном или подводном (в зависимости от времени суток) положении. От острова Лавенсари начинался самый трудный, третий этап протяженностью около 200 миль (370 км). Подводным лодкам предстоял прорыв через охраняемый противником Финский залив. О прорыве на Балтику лодки сообщали радиограммой.

    После разведывательного похода «М-97» к острову Гогланд первый эшелон подводных лодок («Щ-303», «Щ-304», «Щ-317», «Щ-320», «Щ-405», «Щ-406», «С-4», «С-7» и «М-95») был готов к выходу на позиции. Первыми на коммуникации противника 11 июля отправились «Щ-317» (через банку Викола – остров Большой Тютерс) и «Щ-304» (через остров Большой Тютерс – банка Негунд). Результат не заставил себя ждать. 16 июля финский пароход «Арго» стал жертвой торпеды «Щ-317». Счет кампании 1942 года для балтийских подводников был открыт. Немцы, считая блокаду достаточно эффективной, переоценили возможности своей противолодочной обороны. До этого времени у берегов Швеции германские суда, словно в мирное время, ходили без эскорта с включенными ходовыми огнями. Следом за своими боевыми товарищами отправились «М-95» и «С-4» (12 и 13 июня через Северный Гогландский проход), «Щ-320», «Щ-406», «С-7», «Щ-303» (14, 24 июня, 2 и 4 июля через банку Виргины – банку Викола). «Попали под раздачу» и шведы, наивно полагавшие, что нейтральный статус оградит их суда от угрозы из-под воды. Непрекращающиеся протесты МИД Швеции привели к тому, что приказом наркома ВМФ Н.Г.Кузнецова от 14 июля были запрещены атаки судов в шведских территориальных водах, хотя нейтральный статус судна не защищал его от атаки вне этой зоны.

    Не обошлось и без потерь. Жертвой шведских кораблей стала уже получившая «добро» на возвращение «Щ-317», при переходе на Лавенсари пропала без вести «Щ-405», погибла на мине «М-95».

    Командование высоко оценило действия подводных лодок первой группы. Командиры «Щ-406» и «С-7» Осипов Е.Я. и Лисин С.П. были представлены к званию Героя Советского Союза.

    После возвращения с позиций лодок первого эшелона к выходу в открытую часть Балтики стала готовиться вторая группа подводных лодок («М-96», «М-97», М-102», «Щ-309», «Щ-310», «Щ-323», «Щ-407», «С-13», «Л-3» и «Лембит»). 12 августа на позиции вышли «М-96» (через северный Гогландский проход) и «Л-3» (через банку Виргины – банку Викола). 17 и 18 августа этим же маршрутом вышли в море «Щ-309» и «Щ-407», а 21 августа «Лембит». 1 сентября настала очередь «М-97» и «Щ-323». Обе подводные лодки в этот раз не сумели преодолеть противолодочный рубеж. Первая погибла на одной из мин заграждения «Насхорн», вторая получила значительные повреждения и вынуждена была вернуться. 8 сентября успешно завершила прорыв «С-13». Подводная лодка действовала в Ботническом заливе, куда советские субмарины в 1942 году еще не проникали. 20 и 23 сентября через северный Гогландский проход приступили к форсированию заграждений противника «М-102» и «Щ-310». Полагая, что причиной потери первых судов стал подрыв на мине, немцы предприняли траление «опасных районов». Позднее, разобравшись в ситуации, противник усилил состав сил ПЛО, был вынужден ввести систему конвоев, перенес маршруты движения судов ближе к шведским берегам и в мелководные районы, усилил дозорную службу. Среди шведских моряков царило настроение, близкое к панике. Итогом этой нервозности стал инцидент с подводной лодкой «Шёборрен». 4 сентября капитан шведского парохода «Виргиния» обнаружил прямо по курсу подводную лодку. Не долго думая, он таранил субмарину. Не повезло только одному утонувшему члену экипажа подлодки, остальные были спасены. «Шёборрен» была поднята шведами и введена в строй в октябре 1943 года.

    Не дожидаясь возвращения второй группы лодок, командование стало готовить к выходу лодки третьего эшелона, куда включили и боеготовые субмарины, выходившие на позиции в первой группе. Готовились выйти в море «Д-2», «Л-3», «С-7», «С-9», «С-12», «Щ-302», «Щ-303», «Щ-304», «Щ-305», «Щ-306», «Щ-307», «Щ-308», «Щ-311», «Щ-320», «Щ-406» и «М-96». Сравнительно успешные действия подводных лодок первого и второго эшелонов породили известную самоуспокоенность в штабах в безошибочности анализа обстановки в Финском заливе. Противник тем временем делал выводы и принимал меры к защите своего судоходства на Балтийском море. Ему были известны районы появления советских подводных лодок в местах, где они выходили на связь и производили зарядку батарей после форсирования минных полей. Для усиления ПЛО противник использовал даже финские подводные лодки. В районах предполагаемых действий советских подводных лодок немцы осенью выставили ряд минных заграждений, причем мины ставились и в пределах шведских территориальных вод. (15 апреля 1943 года шведская подводная лодка «Ульвен» стала жертвой одной из немецких мин и погибла).

    В итоге подводные лодки третьей волны понесли тяжелые потери. Из 16 подводных лодок в базу вернулись только 8.

    Советское командование высоко оценило действия балтийских подводников в кампанию 1942 года. Подводные лодки «Щ-320» и «Щ-406» были награждены орденом Красного Знамени. В марте 1943 года гвардейского звания удостоены «Щ-303», «Щ-309» и «Л-3». По официальным советским данным подводные лодки КБФ в 1942 году потопили торпедами 34 транспортных судна (93.896 брт) и 1 корабль. 10 транспортов общим водоизмещением 24.330 брт и 1 корабль стали жертвами мин, 3 судна (6.304 брт) потоплены артиллерией. (Всего 47 потопленных и 4 поврежденных судна общим водоизмещением в 124.530 и 19.833 брт и 2 корабля). Действительный итог выглядит несколько скромнее: потоплено 15 судов (32.415 брт) торпедами, 2 (2.061 брт) артиллерией, 5 транспортов (10.907 брт) погибло на минах. Всего 22 судна (45.383 брт).

    Балтийские морские коммуникации имели для немцев большое значение. Они обеспечивали подвоз в Германию дефицитного стратегического сырья, необходимого для промышленности Рейха. Шведская руда давала до 80% стали произведенной в Германии. Немцы нуждались так же в финском лесе и целлюлозе. По балтийским морским путям проводилась перевозка войск и вооружения на советско-германский фронт. По данным Ю. Майстера в немецких конвоях в Балтийском море в 1942 году прошло 203 боевых корабля, 75 госпитальных судов и 1.868 торговых судов общим тоннажем 5.592.189 брт, на которых перевезено 405.459 солдат, 15.454 лошадей, 12.866 транспортных средств и 377. 856 тонн военного имущества. (Ф. Руге приводит еще более крупную цифру: с июня до конца 1942 года общий тоннаж немецких конвоев на Балтике составил 6, 5 млн. брт). Конечно, подводные лодки КБФ не в состоянии были полностью остановить этот транспортный поток, но уже в сентябре у немцев возникли проблемы с организацией конвоев. Кораблей охранения не хватало. В портах Германии и Финляндии скопилась масса груженых судов, ожидающих своей очереди. И хотя потери немцев и их союзников на Балтике в 1942 году составили менее 1% грузооборота, нельзя не принимать во внимание то количество сил и средств, затраченных немцами на обеспечение бесперебойного транспортного сообщения в Балтийском море.