Заложена 9 января 1943 года на судоверфи «Germaniawerft» (по другим данным «Deutsche Werke») в Киле, 11 ноября 1943 года спущена на воду, 12 декабря 1943 года вступила в строй.

    Под командованием капитан-лейтенанта Вернера-Карла Шмидта (Werner-Karl Schmidt) участвовала в боевых действиях против Краснознаменного Балтийского флота. 30 июня 1944 года в районе Бьорке-Зунда подводная лодка потопила советский сторожевой катер «МО-105» (командир старший лейтенант Г. Швалюк). 20 человек из экипажа катера погибли, спасти удалось всего семерых. Спустя семь часов подлодка сама была потоплена глубинными бомбами другого охотника «МО-103» (командир старший лейтенант Коленко). 46 членов экипажа «U-250» погибли. Шестерых, в том числе и командира удалось спасти.

    В 14 сентября 1944 года субмарину подняли, отбуксировали в Койвисто, а затем в Кронштадт где поставили в док.

    20 апреля 1945 года подводная лодка зачислена в состав ВМФ СССР с присвоением обозначения «ТС-14», но уже 20 августа 1945 года ввиду невозможности восстановления она была исключена из списков и разобрана на металл.