Заложена 23 июля 1934 года на заводе № 194 в Ленинграде под стапельным номером 292. В 1935 году секциями по железной дороге подводная лодка перевезена на завод № 202 во Владивосток (по другим данным на завод № 368 в Хабаровск), где была окончательно собрана. 4 июля 1935 года корабль спущен на воду и 11 декабря 1936 года вошел в состав Тихоокеанского флота.

    9 августа 1945 года «Щ-131» встретила под командованием капитан-лейтенанта Зубарева Алексея Трофимовича в составе 1-го дивизиона 1-й бригады ПЛ ТОФа в бухте Улисc, но в боевых действиях только что начавшейся советско-японской войны участия не принимала.

    10 июня 1949 года подводная лодка получила обозначение «С-131», а 9 ноября 1956 года корабль выведен из боевого состава, законсервирован и поставлен на отстой. 29 марта 1957 года подводная лодка разоружена и, получив обозначение «УТС-72» переформирована в учебно-тренировочную станцию. 11 августа 1957 года судно затонуло при буксировке в Уссурийском заливе, но вскоре было поднято аварийно-спасательной службой ТОФа и отбуксировано в бухту Малый Улисс, а 28 января 1958 года расформировано в связи со сдачей на разборку.